Toate proiectele eligibile sunt punctate în acord cu criteriile de selecţie menţionate în Ghidul Solicitantului, fiecare din acest criteriu având stabilit un anumit număr de puncte. Un proiect poate cuprinde cheltuieli eligibile dar şi neeligibile. Fondurile nerambursabile sunt acordate doar pentru decontarea cheltuielilor eligibile. Cheltuielile considerate a fi neeligibile vor fi suportate integral de către beneficiarul proiectului.
Lista tipurilor de investiţii şi cheltuielile eligibile cât şi a celor neeligibile se regăseşte în Ghidul Solicitantului aferent fiecărei Măsuri de finanţare. Ceea ce este de reţinut este faptul că finalizarea proiectului FEADR presupune ca beneficiarul să finalizeze atât partea de investiţie suportată prin cheltuielile eligibile, cât şi partea de investiţie realizată prin cheltuielile neeligibile.
Această clarificare se aplică pentru următoarele măsuri de investiţii: Măsura 121 „Modernizarea exploataţiilor agricole”, Măsura 123 "Creşterea valorii adăugate a produselor agricole şi forestiere", Măsura 312 „Creare şi dezvoltare micro-întreprinderi”, Măsura 313 „Încurajarea activităţilor turistice” şi Măsura 322 „Renovarea si dezvoltarea satelor”. (Lavinia Preda)